L’automobile reste le moyen de transport individuel privilégié par les Brestois, le vélo n’étant que peu utilisé, pour bonne partie en raison du relief de la ville. Deux voies autoroutières gratuites relient Brest à Rennes (RN12) et à Nantes (N165).
La Gare de Brest fut construite entre 1936 et 1937, dans un style Art déco (architecte Urbain Cassan). Le bas-relief en granite rose dont seule ne reste que la partie basse, représente des sujets évoquant la Bretagne (sculpteur Lucien Brasseur)
Desservie par une gare ferroviaire et routière qui surplombe le port de commerce, Brest et son agglomération est également dotée d’un réseau de bus appelé Bibus (CTCUB jusqu'en 1986) composé de 22 lignes dont 3 à la demande. Un projet de tramway est à l’étude par la Semtram, le mode fer étant privilégié. Il parcourra à partir de 2012 la ville d’est en ouest en reliant Technopôle à Kergaradec et Froutven.
L’aéroport de Brest Bretagne, situé sur la commune de Guipavas, est le 1er aéroport breton pour le trafic passagers, représentant 45% de ce trafic dans la région. Une nouvelle aérogare, d'une forme évoquant une raie manta, est en service depuis le 12 décembre 2007, et porte la capacité de l’aéroport à 1,8 millions de passagers par an.